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全程水处理器以及废水中悬浮物和微生物的不断沉积
随着微生物的不断繁殖增长，全程水处理器以及废水中悬浮物和微生物的不断沉积，使生物膜的厚度不断增加。其结果，使生物膜的结构发生了变化。膜的表层和废水接触，由于吸取营养和溶解氧比较容易，微生物生长繁殖迅速，形成了由好氧微生物和兼性微生物组成的好氧层。在其内部和介质接触的部分，由于营养料和溶解氧的供应条件较差，微生物生长繁殖受到限制，好氧微生物难以生活，兼性微生物转为厌氧代谢方式，某些厌氧微生物恢复了活性，从而形成了由厌氧微生物和兼性微生物组成的厌氧层。全程水处理器厌氧层是在生物膜达到一定厚度时才出现的，随着生物膜的增厚和外伸，厌氧层也随着变厚。
在负荷低的净化构筑物内，由于有机物氧化分解比较完全，生物膜的增长速度较慢，好氧层和厌氧层的界限并不明显。但在高负荷的净化构筑内，生物膜增长迅速，好氧层和厌氧层的分界比较明显。
生物膜并不是毫无变化地附着在滤科衣回上，而是不断地增长、更新、脱落的。造成生物膜不断脱落的原因有：水力冲刷，由于膜增厚而造成重量的增大，原生动物的松动，厌氧层和介质的黏结力较弱等。其中以水力冲刷最为重要。从处理要求看，生物膜的更新脱落的完全必要的。
全程水处理器生物膜是生物处理的基础，必须保持足够的数量才能达到净化的目的。一般认为，生物膜厚度介于2mm一3mm时较为理想。生物膜太厚，会影响通风，甚至造成堵塞。厌氧层一旦产生，会使处理水质下降，而且厌氧代谢产物会恶化环境卫生。
生物膜中的物质迁移。由于生物膜的吸附作用，在其表面有一层很薄的水层，称之为附着水层。附着水层的有机物大多已被氧化，全程水处理器其浓度比滤池进水的有机物浓度低得多。因此，进水池内的废水沿膜面移动大，由于浓度差的作用，有机物会从废水中转移到附着水层中去，进而被生物膜所吸附。同时，空气中的氧在溶人废水后，继而进入生物膜。在此条件下，微生物对有机物进行氧化分解和同化合成。产生的二氧化碳和其他代谢产物一部分溶人附着水层，一部分析出到空气中去。如此循环往复，使废水中的有机物不断减少，从而得到净化。
